高通量組織研磨儀如何提高樣品DNA的研磨提取質(zhì)量
2020-11-23 05:27:02
研磨機(jī)的研磨提取,是很多研磨者的選擇之一。但不同的研磨器械所應(yīng)用的性能也有所不同,但那令人心之向往的還是研磨者的高通量組織研磨儀。
實(shí)時定量聚合酶鏈反應(yīng)用于控制提取的核酸/cDNA和基因組DNA的質(zhì)量。為評估所提取的核糖核酸的質(zhì)量,可建立一種特異性的單拷貝基因系統(tǒng),用以量化基因組當(dāng)量和細(xì)胞數(shù)。而該系統(tǒng)用于對DNA質(zhì)量控制的概要,使用該系統(tǒng)針對單拷貝基因,使用ct值來確定某些組織的dna提取質(zhì)量。超過一定閾值的樣本表明dna已經(jīng)被降解,需要重新獲取,而利用系統(tǒng)可對偽基因進(jìn)行靶向復(fù)制。
在準(zhǔn)備研磨提取前,我們需要取新鮮的動物組織做樣品,剪切成50-100mg左右的濕重,用液氮快速冷凍,在-80℃的低溫冰箱中保存。這些被冷凍的組織在DNA提取前,需被放在深孔板中,然后把深孔板放在干冰上進(jìn)行冷凍。每個孔中需加入研磨鋼珠和緩沖液,使其凈化溶解。用高通量的研磨儀器將其深孔蓋密封,開始研磨提取?!?/p>
在50℃下樣品進(jìn)行逆轉(zhuǎn)錄反應(yīng),需加入60微升水,加熱5分鐘至95℃,在冰上進(jìn)行冷卻,使反應(yīng)終止。而樣品提取的dna質(zhì)量是由ct值決定的,是受內(nèi)源受控的。待超過某一閾值時,樣品質(zhì)量會受到影響,RNA總降解,需要再次提取備用樣品。通常用該系統(tǒng)來評DNA的質(zhì)量,其目標(biāo)是具有特定物種的甘油醛-3-磷酸脫氫酶或核糖體基因。
應(yīng)用高通量組織研磨儀對動物組織的研磨提取,不僅能快速、高通量地完成樣品制備,且樣品提出的核酸質(zhì)量好,提取量高。這樣的高通量研磨儀,你還有什么理由不應(yīng)用呢。